Ellen Clara Charlotta Kruse, född 16 mars 1860 i Stockholm, död 11 juni 1933 i Lovö socken, var en svensk skolföreståndare. Hon var syster till Anna Kruse.
Ellen Kruse var dotter till regementsauditören Abraham Ludvig Kruse. Hon fick sin första utbildning i Statens normalskola för flickor, vilken hon lämnade 1876. Hon övergick därefter till Högre lärarinneseminariet. Efter avgångsexamen där 1879 blev hon 1884 lärare vid Brummerska skolan i Stockholm och var föreståndare där 1914–1923. Under hennes tid som föreståndare ökade elevantalet från ett femtiotal till 750. Hon erhöll 1920 Illis quorum.
Källor